More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1854 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  64.25 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  46.29 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 364 aa  291  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.24 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.45 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.28 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 361 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.43 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  38.61 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 372 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  37.99 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 368 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>