More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0665 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  729    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.23 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 363 aa  242  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.61 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  36.74 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10210  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 359 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  34.83 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  38.79 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 		 366 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  39.24 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  35.34 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  35.88 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  37.72 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  35.23 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  36.59 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  34.57 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  33.24 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  38.82 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  36.63 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  36.15 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 		 376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  36.07 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  35.94 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 385 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  36.62 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  35.57 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  36 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  34.72 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>