More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10210  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  731    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  40.8 
 
 		 353 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  40.82 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  39.24 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  39.24 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  37.2 
 
 		 350 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.81 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  37.2 
 
 		 350 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  43.03 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  43.03 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  44.58 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  36.47 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  37.17 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 369 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 		 359 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 359 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  44.71 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  44.57 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  44.64 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  44.71 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  44.15 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>