More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1673 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
363 aa  721    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 
366 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 
366 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.89 
 
 
362 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 
359 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 
368 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  39.45 
 
 
367 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 
354 aa  245  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 
539 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  44.84 
 
 
363 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 
363 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  43.84 
 
 
360 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 
366 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 
360 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 
364 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  45.2 
 
 
364 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  41.38 
 
 
359 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 
352 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 
363 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  36.66 
 
 
363 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 
359 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 
371 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 
363 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.05 
 
 
366 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  40.71 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  37.91 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  40.05 
 
 
366 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.45 
 
 
366 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 
362 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.82 
 
 
356 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 
359 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  43.24 
 
 
368 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 
368 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40.94 
 
 
359 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
370 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  38.27 
 
 
359 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 
366 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
363 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 
363 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  37.68 
 
 
359 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 
355 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.12 
 
 
359 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.16 
 
 
369 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 
359 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 
359 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  38.96 
 
 
366 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.72 
 
 
358 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 
374 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 
350 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 
361 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  43.17 
 
 
367 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 
368 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 
358 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  37.95 
 
 
367 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 
361 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 
369 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 
359 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  38.2 
 
 
372 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  43.29 
 
 
365 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 
365 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  38.22 
 
 
375 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
364 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 
359 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
364 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  40.37 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 
372 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  41.01 
 
 
361 aa  223  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
388 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38.73 
 
 
358 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 
370 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 
358 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
366 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 
385 aa  222  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 
368 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.05 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>