More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1920 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 356 aa  727    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  68.16 
 
 		 355 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  58.66 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  45.24 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  41.71 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.31 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 		 364 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.56 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  39.24 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 370 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  38.52 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  38.5 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  37.47 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1166  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.731457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  38.53 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.96 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  36.94 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 371 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  38.3 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 369 aa  225  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.4 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  36.67 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 		 358 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  37.79 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  35.13 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  38.03 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.86 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  36.09 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  35.94 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  38.12 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  37.11 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  36.21 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  36.01 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 358 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 		 361 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 369 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  36.09 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  36.55 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  37.21 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.36 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  35.53 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.18 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 540 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>