More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1438 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
346 aa  704    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  74.57 
 
 
345 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  62.72 
 
 
346 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  61.08 
 
 
352 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  63.08 
 
 
344 aa  432  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  58.07 
 
 
351 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  58.07 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  57.51 
 
 
351 aa  411  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  58.31 
 
 
348 aa  408  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  52.89 
 
 
349 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 
354 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 
367 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 
431 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.08 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  46.39 
 
 
359 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 
368 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.23 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 
361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  47.55 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  47.55 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  46.39 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 
361 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  45.61 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 
366 aa  281  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  49.84 
 
 
359 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 
358 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 
355 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 
359 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 
362 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.37 
 
 
366 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.37 
 
 
366 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  43.23 
 
 
365 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  48.01 
 
 
358 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 
367 aa  278  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 
358 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 
367 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 
359 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 
367 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 
358 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 
374 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 
358 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 
359 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 
358 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 
359 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  45.2 
 
 
368 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 
359 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
362 aa  276  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.6 
 
 
359 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 
365 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 
376 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 
365 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  43.6 
 
 
359 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.21 
 
 
359 aa  275  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  50.94 
 
 
359 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.64 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.55 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  45.22 
 
 
373 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 
361 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 
368 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 
366 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 
376 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 
388 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  47.45 
 
 
366 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  46.56 
 
 
356 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 
372 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 
372 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  45.75 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  44.34 
 
 
350 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 
362 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 
369 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 
363 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.34 
 
 
361 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  43.03 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 
366 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
363 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  44.06 
 
 
366 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 
358 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  40.33 
 
 
371 aa  265  8e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>