More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1562 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 385 aa  766    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  57.1 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  55.23 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 539 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  47.75 
 
 		 368 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  47.61 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  45.55 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  45.55 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  46.47 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 369 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 363 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.24 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  44.56 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  44.5 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  39.39 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  43.07 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  41.51 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  40.92 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  43.85 
 
 		 371 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.62 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 362 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  39.95 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  45.97 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 361 aa  259  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  44.53 
 
 		 594 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.48 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.43 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  42.78 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 366 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 579 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.57 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 		 604 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  40.16 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  43.26 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.1 
 
 		 372 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.25 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  42.62 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.48 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 579 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  42.75 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>