More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0696 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 352 aa  712    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  72.08 
 
 		 351 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  72.36 
 
 		 351 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  71.79 
 
 		 351 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  63.64 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  61.08 
 
 		 346 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  57.59 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  51.69 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  56.98 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  43.93 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.29 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  45.91 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.65 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.56 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 372 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 366 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.57 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  43.37 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.08 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  38.52 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  43.25 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  44.37 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.33 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  44.37 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.33 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  44.37 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  41.49 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 359 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  43.65 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  46.38 
 
 		 359 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  43.71 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.41 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  40.3 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>