More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1026 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  98.01 
 
 
351 aa  690    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
351 aa  706    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  96.58 
 
 
351 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  71.79 
 
 
352 aa  504  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  61.47 
 
 
345 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  58.07 
 
 
346 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  59.54 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 
346 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  55.24 
 
 
348 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  50.71 
 
 
349 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.13 
 
 
368 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 
365 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 
366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 
366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 
376 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 
365 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 
365 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 
361 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 
388 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  37.93 
 
 
376 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  39.28 
 
 
368 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 
369 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
368 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 
369 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 
359 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 
368 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 
372 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
368 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 
363 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 
358 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 
359 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39 
 
 
368 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.9 
 
 
367 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 
359 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  37.47 
 
 
363 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  40.52 
 
 
368 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 
359 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 
367 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 
373 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.64 
 
 
359 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.15 
 
 
361 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 
359 aa  255  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 
359 aa  255  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 
359 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  38.16 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  39.17 
 
 
359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  39.73 
 
 
368 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  38.66 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 
363 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 
372 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 
358 aa  252  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.46 
 
 
431 aa  251  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.23 
 
 
359 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 
356 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 
361 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  38.59 
 
 
367 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.99 
 
 
361 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  37.19 
 
 
371 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 
359 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
363 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 
367 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  38.58 
 
 
361 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 
365 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 
360 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  43.65 
 
 
363 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  37.57 
 
 
377 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
370 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 
367 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
358 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 
370 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 
366 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
359 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 
372 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  38.72 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>