More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0854 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 346 aa  697    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  62.72 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  60.69 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  62.72 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  57.95 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  53.03 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  45.2 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.84 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.84 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.06 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.78 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  41.78 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  41.81 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  47.59 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 431 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.25 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.65 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.65 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.69 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.69 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  41.93 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  272  7e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.74 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 366 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 366 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.06 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  46.33 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.64 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  45.67 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  45.15 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 366 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 367 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  40.61 
 
 		 364 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.09 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  45.22 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  42.28 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 368 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  46.86 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.14 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.04 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>