More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1020 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 349 aa  716    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  62.32 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  52.89 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  53.47 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  51.69 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  51.84 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  53.03 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  50.99 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  50.71 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  50.87 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  45.04 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 374 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  46.77 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 369 aa  285  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  43.68 
 
 		 368 aa  285  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  47.56 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  45.69 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 359 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.75 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  47.1 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  46.56 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  47.1 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.1 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 359 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 363 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 367 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  44.27 
 
 		 359 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 359 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  44.27 
 
 		 359 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 431 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  44.84 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  45.19 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  42.33 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.33 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.58 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.78 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  42.24 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 		 364 aa  272  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 366 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  46.34 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  42.07 
 
 		 356 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  45.95 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.45 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>