More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0611 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  66.31 
 
 		 560 aa  734    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 540 aa  1100    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  47.06 
 
 		 577 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  52.69 
 
 		 395 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  53.52 
 
 		 380 aa  355  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  53.24 
 
 		 358 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  51.97 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  49.32 
 
 		 370 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 358 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  50.55 
 
 		 370 aa  346  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  49.73 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  47.95 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  49.56 
 
 		 368 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  48.87 
 
 		 368 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  51.98 
 
 		 366 aa  321  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 389 aa  320  6e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  49.73 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  39.11 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  48.39 
 
 		 371 aa  316  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  48.64 
 
 		 365 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  50.71 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 368 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  47.27 
 
 		 371 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  51.18 
 
 		 362 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  46.91 
 
 		 362 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 353 aa  297  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 359 aa  293  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  49.39 
 
 		 360 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  49.39 
 
 		 360 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  49.39 
 
 		 360 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 		 360 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  46.8 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 591 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  35.32 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.97 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  35.4 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 		 579 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 		 604 aa  237  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.02 
 
 		 364 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.16 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.38 
 
 		 539 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 385 aa  223  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  39.52 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 359 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 369 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 368 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 		 366 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 363 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.21 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2548  3-dehydroquinate synthase  44.64 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 		 368 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 		 366 aa  217  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  39.86 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.33 
 
 		 368 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 359 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41.04 
 
 		 359 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 368 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.2 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 366 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 368 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 362 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  35.75 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  36.61 
 
 		 362 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  35.38 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 360 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  37.36 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 368 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  38.02 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  38.54 
 
 		 359 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  39.8 
 
 		 368 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 361 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  40.26 
 
 		 364 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  38.94 
 
 		 365 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  40.26 
 
 		 364 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  36.41 
 
 		 366 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 356 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  36.01 
 
 		 362 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 		 359 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  39.62 
 
 		 359 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>