More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6533 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 358 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  78.77 
 
 		 358 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  69.75 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  68.44 
 
 		 368 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  70.95 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  63.1 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  61.45 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.25 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  59.72 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  61.98 
 
 		 577 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  57.94 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  60.91 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  57.89 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  58.59 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 368 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  57.85 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  58.22 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  58.71 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  57.97 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  55.68 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  57.46 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  56.94 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  56.37 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  57.91 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  55 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 540 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  56.25 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  54.96 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  55.4 
 
 		 519 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  57.5 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  57.5 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  57.5 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 560 aa  319  6e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 593 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1732  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0986933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  42.07 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  35.34 
 
 		 364 aa  226  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.53 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  35.94 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 359 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  36.81 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  35.36 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.03 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  34 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  33.05 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  39.28 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  32.76 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  34.49 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  36.89 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.29 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  35.87 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 372 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  41.12 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.42 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  32.18 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.04 
 
 		 361 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  41.59 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>