More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15571 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 372 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  74.31 
 
 		 371 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  69.54 
 
 		 377 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  64.13 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  63.59 
 
 		 368 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  58.97 
 
 		 370 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  58.13 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  57.73 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  56.7 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  57.89 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  56.7 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  50.55 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  55.12 
 
 		 364 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  56.75 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  49.71 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  49.13 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  47.61 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  47.7 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  45.23 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.81 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.98 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  51.18 
 
 		 364 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  44.08 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  47.69 
 
 		 539 aa  275  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  44.96 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  44.21 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1555  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.267288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  44.65 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.23 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  40.88 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.08 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  40.93 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  41.89 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  41.1 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  41.37 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  42.62 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.68 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  46.83 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.19 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  44.25 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>