More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0093 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 371 aa  736    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  83.19 
 
 		 352 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  51.62 
 
 		 539 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  55.52 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 364 aa  318  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  45.82 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  46 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  42.44 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  42.15 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 363 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  45.05 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  41.14 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.62 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  41.78 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  44.29 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.23 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 358 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  45.95 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  44.83 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.04 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 368 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  47.48 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 591 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  45.21 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  47.73 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 350 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  46.27 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  40.16 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  45.68 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  45.03 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  48.25 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.55 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  47.71 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  43.49 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  43.2 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  45.18 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.83 
 
 		 374 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  42.95 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.49 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  46.87 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  44.76 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  46.36 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  45.91 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  45.76 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>