More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0038 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  51.57 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  51.57 
 
 		 217 aa  185  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  46.99 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  52.2 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 604 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 579 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 579 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  49.42 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  50 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  51.57 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  45.03 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  48.19 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 593 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  43.98 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  43.9 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  43.71 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  41.21 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  48.1 
 
 		 591 aa  157  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  45.86 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  45.86 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  44.32 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  41.82 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  45.86 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  44.3 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  41.21 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  42.35 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  46.85 
 
 		 594 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  43.29 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  44.85 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  51.05 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 615 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 552 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  37.87 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  41.21 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  38.04 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  41.25 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  46.85 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  43.17 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0395  shikimate kinase  43.02 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  38.89 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  124  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.89 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  38.89 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  37.65 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  37.04 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  38.18 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  38.04 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  37.42 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  37.42 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  37.42 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  37.42 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  37.42 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  37.42 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  37.42 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  38.04 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  36.48 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  36.81 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  39.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  38.04 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  36.81 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  40.49 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.31 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  40.49 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  36.97 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  33.94 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  36.26 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  36.81 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  37.93 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  39.51 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  39.62 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  39.43 
 
 		 198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  35 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  38.99 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  36.2 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.29 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  35 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  35 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  35 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  38.86 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  35.62 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>