More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0030 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  100 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  61.58 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  54.9 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  56.1 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  53.85 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  59.15 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  56.1 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  51.69 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  51.44 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  49.06 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  51.21 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  51.66 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  55.29 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  55.29 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  49.28 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  48.8 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  53.85 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  55.12 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  56.57 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  52.15 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  55.34 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  52.91 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  56.67 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  48.31 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  57.37 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  50 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  55.79 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  51.3 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.14 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.42 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  34.93 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  34.96 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  35.84 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.55 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  41.3 
 
 		 243 aa  137  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 514 aa  137  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>