More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1351 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1351  cytidylate kinase region  100 
 
 		 200 aa  373  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  35.89 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  37.86 
 
 		 244 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  36.04 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  35 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  34.15 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  38.14 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  35.94 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  33.49 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  32.35 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  33.02 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  36.62 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  33.49 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  31.58 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  30.19 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  32.04 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.19 
 
 		 527 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.07 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  34.55 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  28.43 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  33.48 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  28.43 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  28.57 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  37 
 
 		 243 aa  88.2  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  35.68 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  31.92 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  35.85 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  35.38 
 
 		 251 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  27.65 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  34.31 
 
 		 233 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  35.86 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  30.84 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  29.22 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  37.25 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  33.02 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  30.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  29.38 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  29.61 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  31.51 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  29.38 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  37.31 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  35 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  35.71 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  31.58 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  26.98 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  31.65 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  27.65 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  31.58 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  33.65 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  35.82 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  31.55 
 
 		 511 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  30.81 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  31.55 
 
 		 511 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  33.95 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  31.25 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  27.19 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  28.7 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  30.77 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  31.98 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  37.09 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  33.48 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  28.64 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  28.24 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  27.49 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  34.15 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  30.05 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  32.68 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  37.37 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  32.43 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  41.61 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  32.84 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  28.16 
 
 		 517 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  35.03 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  28.17 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  32.39 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  35.02 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  32.86 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  29.46 
 
 		 811 aa  78.6  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  34.63 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  34.68 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>