More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6548 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  90.24 
 
 		 217 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  68.14 
 
 		 216 aa  254  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  69.86 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  76.35 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  76.35 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  62.68 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  73.4 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  74.88 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  64.88 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  60.77 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  59.33 
 
 		 212 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  59.33 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  58.85 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  55.88 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  57.64 
 
 		 219 aa  214  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  57.64 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  60.78 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  59.33 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  56.46 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  54.41 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  59.33 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  56.04 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  53.69 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  54.41 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  59.22 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  55.67 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  49.75 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  58.42 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  55.03 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  58.25 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  52.17 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  52.2 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 194 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  53.54 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  46.01 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  45.02 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.66 
 
 		 699 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  52.2 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  48.28 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  48.28 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  48.28 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  52.2 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  54.07 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  46.31 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  45.85 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  49.5 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  50.76 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  47.29 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.57 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  55.5 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  44.06 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  43.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  43.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  43.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  47.52 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  43.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 240 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  46.86 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  44.06 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  42.03 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>