15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3842 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  37.64 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  37.35 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  39.33 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  39.66 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  39.18 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  26.38 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  30.15 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.35 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  31.82 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  28.49 
 
 		 189 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2885  hypothetical protein  30.65 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.264344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl144  adenylate kinase  26 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>