21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3588 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  85.03 
 
 
188 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  47.06 
 
 
183 aa  158  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  46.86 
 
 
189 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  44.51 
 
 
193 aa  147  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  45.83 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  39.16 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  39.66 
 
 
176 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  30.11 
 
 
181 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  33.94 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  39.44 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  25.88 
 
 
177 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  36.62 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  24.7 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  26.87 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  21.3 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  35.09 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  25.95 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  25.35 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  27.14 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>