69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0781 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  48.04 
 
 
178 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  49.44 
 
 
186 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  63.74 
 
 
592 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  37.66 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  32.4 
 
 
176 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  36.11 
 
 
167 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  37.29 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  30.67 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  31.37 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  26.92 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  31.02 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  28.65 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  32.59 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  32 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  33.53 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  36.26 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  24.46 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  31.15 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  31.58 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  35.97 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  34.08 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  37.14 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  37.14 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  28.23 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  28.67 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  28.67 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  28.67 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.96 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  27.2 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  27.2 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.98 
 
 
180 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  27.2 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  27.2 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  27.2 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  28.35 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  28 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  28 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  25.6 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  31.78 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.32 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  35.24 
 
 
163 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  28.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  25 
 
 
148 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.56 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  24.8 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  27.61 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  26.12 
 
 
171 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  31.2 
 
 
184 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.95 
 
 
167 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  32.98 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  30.23 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  21.43 
 
 
180 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  33.8 
 
 
173 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  28.57 
 
 
163 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  29.46 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  22.46 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  30.53 
 
 
175 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  32.77 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  24.56 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  26.02 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  36 
 
 
495 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  34.72 
 
 
129 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0805  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  32.14 
 
 
437 aa  41.6  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0535279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>