98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2668 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  43.71 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  43.64 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  42.42 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  41.62 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  41.62 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  41.62 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  41.62 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  41.72 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  40.36 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  40.36 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  40.36 
 
 		 167 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  39.26 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  46.34 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  38.24 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  44.44 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  41.06 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  48.94 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  44.38 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  41.36 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.97 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.03 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  47.24 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.09 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  36.84 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.73 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  36.13 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  33.59 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  29.19 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  30.16 
 
 		 148 aa  94.4  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  32.95 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  38.89 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  36.57 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  37.24 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  38.2 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  25.7 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  37.86 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  39.33 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  32.69 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  37.14 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  27.75 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  37.14 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  36.69 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  41.28 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  30.46 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  33.14 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  28.74 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  37.62 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  33.7 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  41.57 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  38.89 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  28.39 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  36.67 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  30.43 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  42.27 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  32.35 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  33.03 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  37.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  37.5 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  39.33 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  29.94 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  31.07 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  31.82 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  39.36 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  44.87 
 
 		 592 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  29.13 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  26.16 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  32.61 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  29.03 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  28.07 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  34.95 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  31.18 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  30.15 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  27.66 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  24.27 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  44.68 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  23.02 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  29.19 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  23.53 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  27.07 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  28.18 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  46.81 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0757  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  39.29 
 
 		 439 aa  42.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1061  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  37.93 
 
 		 439 aa  42  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  55.26 
 
 		 235 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  33.85 
 
 		 448 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143891  normal  0.73226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  27.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1222  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  35.71 
 
 		 440 aa  40.8  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0503856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  27.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0689  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  35.71 
 
 		 439 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.897729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0764  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  35.71 
 
 		 439 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  27.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  27.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  27.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>