80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3495 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  86.02 
 
 		 186 aa  333  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  84.53 
 
 		 192 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  57.4 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  53.29 
 
 		 167 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  42.77 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  37.21 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  36.14 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  34.94 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  34.94 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  34.94 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  35.09 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  34.94 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  35.93 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  34.73 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  34.34 
 
 		 172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  35.33 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  34.73 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  33.73 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  37.21 
 
 		 175 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  37.13 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  33.91 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  37.02 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  33.14 
 
 		 181 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.12 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  37.72 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  35.71 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  29.56 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.72 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  33.57 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  38.1 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.88 
 
 		 177 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  30.68 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  30.39 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  30.39 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  33.08 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  33.73 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  32.34 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  28.24 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  33.03 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  26.86 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  28.49 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1620  hypothetical protein  64.15 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  31.25 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  29.52 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  32.34 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  34 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  35.87 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  26.47 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  30.1 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  27.27 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  37.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  26.39 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  28.99 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  34.78 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  25.57 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  27.83 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  26.62 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  25.25 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  35.62 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  27.7 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  26.67 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  26.67 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  30.61 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  36.78 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  31.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  28.47 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  29.59 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  34.85 
 
 		 592 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  22.92 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  24.5 
 
 		 594 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  39.66 
 
 		 179 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  23.36 
 
 		 181 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  48.57 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  48.57 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  23.64 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>