86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2513 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  57.87 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  53.04 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  55.15 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  45.77 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  44.85 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  41.4 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  38.18 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  41.91 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  39.77 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  38.64 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  38.64 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  36.46 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  38.12 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  25.57 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  36.07 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  39.88 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  30.06 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  41.46 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  40.54 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  37.3 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  36.87 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  43.4 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  35.92 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  32.95 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.9 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.33 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  42.16 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.63 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.83 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  28.46 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  37.23 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  30.61 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  37.57 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  28.46 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  28.46 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  28.7 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  29.55 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  27.87 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  28.46 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  28.46 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  35.29 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  28.46 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  26.83 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  26.02 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  28.57 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  27.83 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  28.46 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.36 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  26.01 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  26.96 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  28.25 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  27.36 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 592 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  24.24 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  27.18 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  26.13 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  23.12 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  33.67 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  34.83 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  28.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  31.09 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  26.92 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  28.16 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  25.41 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  25.57 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  25.57 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  25.83 
 
 		 177 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0587  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 492 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  30.1 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  27.01 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1293  Sigma 54 interacting domain protein  26.28 
 
 		 411 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  25.83 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  45.45 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0572  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  58.06 
 
 		 492 aa  42.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  37.39 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 		 270 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  32.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  55 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15180  cytidylate kinase  39.66 
 
 		 248 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>