81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3933 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  100 
 
 
181 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  48.82 
 
 
172 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  48.54 
 
 
172 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  48.54 
 
 
172 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  48.54 
 
 
172 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  48.54 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  47.31 
 
 
167 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  47.31 
 
 
167 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  47.37 
 
 
172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  47.37 
 
 
172 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  47.93 
 
 
167 aa  176  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  48.17 
 
 
172 aa  174  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  44.91 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  44.38 
 
 
175 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  38.24 
 
 
181 aa  147  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  38.18 
 
 
167 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.26 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  38.99 
 
 
165 aa  134  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  35.09 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.54 
 
 
192 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  34.73 
 
 
167 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  40.43 
 
 
163 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  44.88 
 
 
179 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.99 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  41.03 
 
 
180 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  40.14 
 
 
189 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  32.94 
 
 
184 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  38.58 
 
 
148 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.14 
 
 
184 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  31.3 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.72 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  38.38 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  38.38 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  31.16 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  29.89 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  33.96 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  35.23 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  35.05 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  31.96 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  32.59 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  31.62 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  30.06 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  31.62 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  36.19 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  32.22 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  31.93 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  30.46 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  31.93 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  32.22 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  28.65 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  33.01 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  31.07 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  31.82 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  28.31 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  31.37 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  28.3 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  28.89 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  35.87 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  24.72 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  28.1 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  32.32 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  34.25 
 
 
592 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  28.12 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  30.48 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  27.37 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  32.69 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  26.62 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  23.81 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  28.36 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  26.47 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  28.06 
 
 
180 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  27.72 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  29.36 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0839  adenylate kinase  27.32 
 
 
218 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257745  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  25.56 
 
 
171 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  29.75 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>