67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3510 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  64.16 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  56.52 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  57.87 
 
 
186 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  48.95 
 
 
206 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  43.05 
 
 
192 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  44.38 
 
 
186 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  41.67 
 
 
191 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  43.54 
 
 
179 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  42.86 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  42.86 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  34.13 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  36.96 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  34.25 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  32.94 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  33.56 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  36.13 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  39 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  30.23 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  30.06 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  29.34 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  31.07 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  22.84 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  28.16 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  25.88 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  35.58 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  26.85 
 
 
165 aa  54.3  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  36.89 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  27 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  26.21 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  26.06 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.34 
 
 
177 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  25.51 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  22.15 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  30.69 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  46.55 
 
 
592 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  25.24 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  29.76 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.95 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  24.44 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.33 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  27.36 
 
 
167 aa  48.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  30.85 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  33 
 
 
184 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  30.39 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.5 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  26.21 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  25 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  28.16 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  23.3 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  25.87 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  24.27 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  25.24 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  26.53 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  26.06 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  24.27 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  24.27 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  43.18 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  30.69 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  25.24 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  51.61 
 
 
495 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  37.78 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  22.87 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  27.97 
 
 
177 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  24.27 
 
 
172 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1031  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  44.12 
 
 
441 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0178353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>