79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2995 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  60.12 
 
 		 192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  58.58 
 
 		 186 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  57.4 
 
 		 200 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  48.52 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  42.51 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  37.87 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  36.09 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  36.47 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  30.72 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  30.72 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  30.72 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  30.72 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  29.59 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  30.18 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  29.59 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  29.52 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  29.24 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  41.03 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  36.09 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  34.71 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  28.31 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  28.07 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  32.28 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.17 
 
 		 184 aa  97.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  37.75 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  36.73 
 
 		 163 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  34.55 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.46 
 
 		 198 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  35.34 
 
 		 148 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  37.01 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  30.64 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  32.17 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  31.25 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  34.65 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  30.9 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  42.05 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  30.06 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  33.33 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  29.52 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  32.35 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  25.14 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  37 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  28.32 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  35.63 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  31.62 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  35.64 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  35.64 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  41.1 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  27.98 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  30.77 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  30.07 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  26.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  30.25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  30.25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  31.36 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  34.34 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  31.9 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  34.91 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  36.47 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  27.96 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  26.28 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  31.76 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  30.95 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  24.75 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  27.35 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  27.66 
 
 		 592 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  31.67 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  30.7 
 
 		 184 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  25.4 
 
 		 594 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  31.86 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>