74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2924 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  344  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  49.38 
 
 
162 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0689  hypothetical protein  48.73 
 
 
159 aa  144  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  39.49 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  33.55 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  33.13 
 
 
209 aa  94  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  29.81 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  28.75 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  26.83 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  25.15 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  33.58 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  30.85 
 
 
206 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  32.48 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  32.35 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  26.75 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  30.39 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  31.58 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  29.31 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  31.37 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  31.37 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  31.52 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  31.37 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  31.37 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  34.78 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  34.78 
 
 
177 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.96 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  33.33 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  30.39 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  31.03 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  30.48 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  28.42 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  31.37 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.08 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.31 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  32.61 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  30.39 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  29.01 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  32.97 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  30.93 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  32.98 
 
 
207 aa  50.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  26.42 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  28.3 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  28.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  31.82 
 
 
202 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  31.18 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  29.55 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  29.13 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  33 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  34.78 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  34.78 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  28.09 
 
 
186 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  27.18 
 
 
189 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  28.09 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  26.37 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  28.57 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  22.97 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  29.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  25 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  23.93 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  26.47 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  22.83 
 
 
186 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  22.92 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  31.88 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  24.27 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  26.92 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  26.27 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  25.19 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  23.3 
 
 
189 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  34.18 
 
 
592 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  34.78 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  28.09 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  32.91 
 
 
550 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  25.74 
 
 
198 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>