74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5529 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  393  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  56.52 
 
 
189 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  56.55 
 
 
191 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  53.04 
 
 
186 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  47.83 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  43.43 
 
 
186 aa  98.2  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  39.86 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  37.66 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  30.18 
 
 
176 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  39.73 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  38.64 
 
 
178 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  38 
 
 
201 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  38 
 
 
201 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.55 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  26.04 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  32 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  31.91 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.12 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  33.14 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  39.26 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  31.93 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  32.62 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  35.59 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.06 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  28.74 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.52 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  37.5 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  31.07 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  29.52 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  42 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  30 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  22.35 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  27.33 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  30 
 
 
165 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  35.71 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  27.38 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  28.16 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  28.57 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  28.71 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  29.13 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  28.16 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  23.7 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  33.66 
 
 
175 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  22.99 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  27.78 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  27.18 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  27.18 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  34.31 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  27.18 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  32.35 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  27.18 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  27.18 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  33.62 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  27.18 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  28.74 
 
 
167 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  26.21 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  31.68 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  31.82 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  26.88 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  33.98 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  25.27 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  45.65 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  32.76 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  27.17 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  27.1 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  26.36 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  27.43 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  26.86 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  28.87 
 
 
264 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
592 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>