40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3033 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  59.55 
 
 		 193 aa  217  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  49.43 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  47.06 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  45.81 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  42.78 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  36.52 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  39.13 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  26.74 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  35.23 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  27.66 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  26.67 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.55 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  29.67 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.73 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  23.64 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  25.93 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  25.19 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  28.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  25.19 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  29.21 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  25.19 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  25.93 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  26.97 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  23.08 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  30.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  25.19 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  32.17 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  33.04 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  25.19 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  26.86 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  27.37 
 
 		 209 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  41.51 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  41.51 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  41.51 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  24.63 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  27.27 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  24.78 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  26.5 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>