71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5223 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  46.45 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  49.11 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  43.56 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  33.51 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  36.13 
 
 		 162 aa  92  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  30.97 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  35.12 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.63 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0689  hypothetical protein  28.3 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  26.14 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  26.7 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  26.7 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  26.7 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  26.7 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  26.7 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  32.73 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  32.73 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  33.02 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  25.88 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  31.73 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  25.57 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  34.41 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  38.89 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.59 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  31.13 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  24.26 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.18 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  31.58 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  24.11 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  30.77 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  24.85 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  24.85 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  34 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  39.13 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  31.73 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  25.66 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  33.62 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  30.06 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  31.13 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  39.13 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  33.02 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  30.84 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  29.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  24.77 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  24.31 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  23.81 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  29.91 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  29.47 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  27.1 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  23.81 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  28.42 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  26.85 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  28.44 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  32.94 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  21.43 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0953  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpX  31.76 
 
 		 429 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.254079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  26.99 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  31.63 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  31.11 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  25.95 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  28.12 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  34.78 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  29.63 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  27.37 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  27.93 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  31.58 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>