73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3219 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  366  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  52 
 
 
175 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  35.07 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  34.57 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.69 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  34.36 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  34.88 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  36.72 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  38.28 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  32.52 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  37.8 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  33.73 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  34.38 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.74 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  34.38 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  34.38 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.54 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  33.59 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  38.66 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  32.03 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  33.59 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  34.43 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  36.36 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  27.33 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  36.27 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  35.14 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  33.66 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  36.89 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  30.7 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  33.03 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.85 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.64 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  28.69 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  33.96 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  32.94 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.41 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  31.68 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  32.67 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  38.2 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  26.09 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  32.32 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  33.66 
 
 
202 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  32 
 
 
206 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  30.84 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  31.07 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  33.66 
 
 
179 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  33.66 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  33.66 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  35.56 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  28.31 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  33 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  25.3 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  34.44 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  27.78 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  28.43 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  34.44 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  31.54 
 
 
632 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  28.32 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  30.53 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  39.71 
 
 
629 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  32.94 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  27.78 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  29.55 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  34.41 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  27.78 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  31.4 
 
 
630 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  30.34 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  26.72 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  38.24 
 
 
630 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  32.89 
 
 
195 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  30.08 
 
 
629 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>