88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1586 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  86.03 
 
 		 179 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  54.75 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  51.16 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  41.28 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  32.97 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  34.64 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  36.05 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  34.88 
 
 		 201 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  34.88 
 
 		 201 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  35.56 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  32.16 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  35.09 
 
 		 167 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  34.67 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.61 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  41.91 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  31.03 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  30.46 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  29.21 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  29.48 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  28.1 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  28.32 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  30.06 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  28.32 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  28.32 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  28.32 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  35.05 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  29.24 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  27.84 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  28.49 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  31.91 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  30.99 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  31.37 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  34.29 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  36.08 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  28.07 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.2 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  28.74 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.06 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  32.32 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  33.56 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  32.67 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.69 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  26.47 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  36.89 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  33.71 
 
 		 592 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  34.02 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  24.7 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  28 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  28.02 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.32 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.65 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  28.85 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  39.13 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  27.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  29 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  30.85 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  30.23 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  28.41 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  23.84 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  27.59 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  24.58 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  32.23 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  51.22 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  32.98 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  29.55 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  33.87 
 
 		 495 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  36.62 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  26.38 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  21.55 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  28.95 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  23.64 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  27.91 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  23.28 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  30.21 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  41.03 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  29.82 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  28.57 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  28.41 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  36.36 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  34.78 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0075  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  48.39 
 
 		 304 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  47.73 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>