76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1914 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  100 
 
 
148 aa  312  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  60.69 
 
 
179 aa  194  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  42.86 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  42.86 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  42.86 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  42.06 
 
 
172 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  41.27 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  42.06 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  39.68 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  42.06 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  42.06 
 
 
167 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  41.27 
 
 
172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  42.06 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.51 
 
 
186 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  38.58 
 
 
181 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  38.1 
 
 
172 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.71 
 
 
192 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  38.1 
 
 
165 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  35.71 
 
 
200 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  37.3 
 
 
167 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  38.46 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  30.16 
 
 
181 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.66 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  32.28 
 
 
191 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.34 
 
 
180 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  31.71 
 
 
184 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  31.01 
 
 
189 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  29.92 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  37.21 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  29.27 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.43 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  32.65 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  28.12 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  26.77 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  33.01 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  32.32 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  36.36 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  31.68 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  33.33 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  25.2 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  31.07 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  24 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  28.16 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  25.2 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  25.2 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  25.2 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  23.53 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  29.01 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  23.3 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  26.14 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  32.89 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  25.74 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  27.45 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  26.77 
 
 
209 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  25 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  22.09 
 
 
186 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  29.31 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0689  hypothetical protein  37.62 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  26.67 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  29.89 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  27 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  25.53 
 
 
180 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  37.23 
 
 
226 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  37.23 
 
 
226 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  28.97 
 
 
198 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  27.59 
 
 
177 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  26.44 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.36 
 
 
593 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83065  Glucokinase  37.84 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235802  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  29.17 
 
 
592 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  26.67 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  24.53 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  27.59 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>