More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1718 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  41.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  39.05 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  39.05 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  39.05 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  40.49 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  44.38 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  38.46 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  38.65 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  37.06 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  39.88 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  38.89 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  38.65 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  37.42 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  36.81 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.67 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  38.24 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  36.97 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  32.93 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  32.53 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  36.9 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  32.94 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.74 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.17 
 
 		 180 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  36.49 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  35.77 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  29.14 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  35.5 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.93 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  35.66 
 
 		 163 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  34.38 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  29.41 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  29.61 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  35.29 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  31.46 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  38.93 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  34.46 
 
 		 177 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  31.71 
 
 		 148 aa  84.3  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  34.23 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  34.23 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  33.56 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  28.98 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  31.48 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  34.69 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  28.74 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  28.42 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  28.65 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  34.12 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  32 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  35.12 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  39.17 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3510  adenylate kinase  36.36 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21010  adenylate kinase  36.67 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0716  adenylate kinase-like kinase  29.49 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542973  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  37.76 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  30.11 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  42.11 
 
 		 592 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1428  hypothetical protein  43.33 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  37.36 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  37.89 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  30.11 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  31.03 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  28.16 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  26.75 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  29.03 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  30.5 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  26.88 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  25.81 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  28.41 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  24.85 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  25.24 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  38.33 
 
 		 447 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0321  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  35.62 
 
 		 408 aa  47.8  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 440 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 447 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 447 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  36.67 
 
 		 445 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 445 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2178  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  37.29 
 
 		 464 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 447 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0396  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 445 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  33.77 
 
 		 440 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0684  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  39.66 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1342  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  38.33 
 
 		 460 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00196912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 441 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0988  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  37.25 
 
 		 453 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0417  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  38.98 
 
 		 411 aa  45.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2368  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  35.59 
 
 		 440 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.421768  hitchhiker  0.00000674723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  35 
 
 		 443 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  36.67 
 
 		 446 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2748  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  35.59 
 
 		 440 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  36.67 
 
 		 444 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  30.85 
 
 		 440 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1980  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  35.59 
 
 		 466 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000459444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  33.33 
 
 		 446 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>