62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0310 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0310  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003381  adenylate kinase  73.68 
 
 		 171 aa  273  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4266  hypothetical protein  72.51 
 
 		 171 aa  265  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2592  hypothetical protein  47.27 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.194494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  40.61 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  30.36 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  28.31 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  37.5 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  30.36 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  35.29 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  29.17 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  29.17 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  37.5 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  29.17 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  29.17 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  29.17 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  28 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  27.98 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  33.01 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  37.61 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  26.86 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  32.16 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  31.68 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  32.04 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  32.26 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  28.31 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  31.86 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  26.09 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  32.38 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  24.42 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  36.84 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  23.23 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  32.67 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  35.35 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.34 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  26.63 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  26.12 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  25.84 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  26.29 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  32.97 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  25.81 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  25.86 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1806  DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  32.08 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415685  hitchhiker  0.00239824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  25.47 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  28.12 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  31.96 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  35.94 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  29.89 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  31.25 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  23.64 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  24.55 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  26.92 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  34.85 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  34.38 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  28.85 
 
 		 166 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  23.14 
 
 		 220 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>