58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4037 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4037  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  361  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  48.55 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0944  hypothetical protein  42.46 
 
 
180 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31136  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  45.39 
 
 
177 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  36.21 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  35.06 
 
 
162 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2114  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  27.44 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  31.11 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3635  hypothetical protein  35.85 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0689  hypothetical protein  24.4 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  34.19 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  28.49 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4977  topology modulation protein  36.52 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0935633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4913  hypothetical protein  27.45 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  27.27 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  25 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  34.51 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  26.82 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  27.66 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.12 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3933  DNA topology modulation protein  31.86 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  23.98 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  33 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  26.29 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  24 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  24 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  24 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6758  adenylate kinase and related kinases  30.77 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200925  normal  0.0315593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6524  adenylate kinase and related kinases  30.77 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  23.43 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3646  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.82 
 
 
192 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  30.09 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2045  topology modulation protein  28.57 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000523613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  30.97 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5450  adenylate kinase-like kinase  31.96 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1976  adenylate kinase  27.97 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00462733  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1898  topology modulation protein  24.58 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3388  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  29.2 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506216  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1889  DNA topology modulation protein FlaR-related protein  32.67 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.495618  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  34.82 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1370  putative adenylate kinase  28 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.666365  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4383  hypothetical protein  31.43 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  28.97 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003219  DNA topology modulation protein  25.74 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  34.55 
 
 
202 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63390  putative adenylate kinase  30 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6347  adenylate kinase and related kinase  30.63 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5705  putative DNA topology modulation protein FlaR  27.62 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.359545  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1634  hypothetical protein  34.34 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.430768  normal  0.0990315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  26.72 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7166  adenylate kinase-like kinase  27.27 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0138  hypothetical protein  27.07 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2513  adenylate kinase  30.69 
 
 
186 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1914  topology modulation protein  31.19 
 
 
148 aa  42  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2464  hypothetical protein  30.63 
 
 
177 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3645  hypothetical protein  30.63 
 
 
177 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.722014  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  26.36 
 
 
183 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>