31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2404 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  49.72 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  46.86 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  46.29 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  45.81 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  44.38 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  39.33 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  32.37 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0662  putative DNA topology modulation protein FlaR  31.09 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2124  hypothetical protein  25.93 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0710971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  23.31 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  23.31 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  23.31 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  21.8 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  24.81 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5529  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  21.8 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  27.34 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0084  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  27.13 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  27.27 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  23.9 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  22.56 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  28.18 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  22.63 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  28.41 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  45.71 
 
 		 495 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  23.53 
 
 		 167 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  23.3 
 
 		 167 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003218  hypothetical protein  22.41 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  23.31 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>