33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3881 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  85.03 
 
 
188 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  49.43 
 
 
183 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  46.29 
 
 
189 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  45.66 
 
 
193 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  41.88 
 
 
183 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  45.12 
 
 
180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  37.35 
 
 
176 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  29.57 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  33.63 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  43.59 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  43.59 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  43.59 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  24.65 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  26.62 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  25.9 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  25.9 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  25.18 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  25.9 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  32.77 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2876  hypothetical protein  35.21 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00207922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5223  hypothetical protein  26.99 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195245  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  26.62 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2231  hypothetical protein  24.1 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  25.18 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1805  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  30.77 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0441384  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  24.26 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  25.9 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.43 
 
 
161 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  31.37 
 
 
189 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.43 
 
 
161 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2995  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  31.86 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637116  normal  0.153689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>