49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3248 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3881  hypothetical protein  41.88 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  37.64 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3588  hypothetical protein  39.16 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116904  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2404  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3033  hypothetical protein  36.52 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2665  hypothetical protein  36.16 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.063622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  31.98 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2525  hypothetical protein  29.35 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123502  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  29.57 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1586  hypothetical protein  32.98 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2668  adenylate kinase-like kinase  23.02 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  31.19 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  27.93 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  30 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  28.1 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  30 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0567  hypothetical protein  20.57 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4100  hypothetical protein  27.18 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  31.9 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  31.53 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  31.71 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2885  hypothetical protein  29.06 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.264344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  28.95 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2924  hypothetical protein  25.19 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  28.38 
 
 		 190 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  28.83 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0695  carbohydrate kinase  44.44 
 
 		 163 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.33 
 
 		 161 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.33 
 
 		 161 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1539  putative adenylate kinase  26.67 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  28.85 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  28.85 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1776  shikimate kinase II  26.79 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.769228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  27.45 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  28.85 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  28.85 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  28.85 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  28.18 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  28.57 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  53.12 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  43.59 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  43.59 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2125  hypothetical protein  23.2 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  28.57 
 
 		 165 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  43.59 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3495  IstB ATP binding domain-containing protein  23.94 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  31.19 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  31.19 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>