13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2885 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2885  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.264344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14450  shikimate kinase  45.27 
 
 		 137 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1303  hypothetical protein  40.79 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0009  hypothetical protein  31.98 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.336851  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12960  hypothetical protein  29.75 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1628  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.0604015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3630  hypothetical protein  29.11 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1197  hypothetical protein  26.19 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0688  hypothetical protein  28.82 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4895  hypothetical protein  28.24 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.581623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2759  hypothetical protein  64.52 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0611938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  29.06 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  30.65 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>