11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0009 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.336851  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2885  hypothetical protein  31.98 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.264344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3630  hypothetical protein  30.54 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0688  hypothetical protein  36.44 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4895  hypothetical protein  36.44 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.581623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12960  hypothetical protein  31.14 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1628  hypothetical protein  36.44 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.0604015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1197  hypothetical protein  29.07 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1303  hypothetical protein  27.01 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14450  shikimate kinase  26.88 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  28 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.300006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>