More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0572 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0587  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  99.8 
 
 		 492 aa  970    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0572  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 492 aa  971    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  29.75 
 
 		 591 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  29.81 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  28.96 
 
 		 552 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  28.81 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  27.85 
 
 		 532 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  31.33 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  28.13 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  28.82 
 
 		 579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  28.82 
 
 		 604 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  29.5 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1634  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  30.34 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.412877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  32.4 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  32.09 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  33.02 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  30.54 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  28.44 
 
 		 579 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  32.89 
 
 		 366 aa  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  34.95 
 
 		 355 aa  150  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  31.56 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  32.82 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  33.55 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_002620  TC0648  3-dehydroquinate synthase  39.42 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.438257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 367 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  31.97 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  31.25 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  34.3 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  33.89 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  32.65 
 
 		 361 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  34.3 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  30.84 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  31.31 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  33.57 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0104  3-dehydroquinate synthase  35.58 
 
 		 343 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  30.63 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0208  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  33.57 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  33.57 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  32.23 
 
 		 350 aa  143  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 368 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  31.85 
 
 		 363 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  31.99 
 
 		 359 aa  143  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  33.21 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  30.22 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  29.91 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  31.85 
 
 		 363 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  29.91 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  32.58 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  34.27 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  33.55 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  29.91 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  35.32 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  31.03 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  32.84 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  32.05 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  34.06 
 
 		 366 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 364 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 364 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1378  3-dehydroquinate synthase  31.31 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.835193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  32.6 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  32.3 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1281  3-dehydroquinate synthase  33.89 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  31.21 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  33.71 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2746  3-dehydroquinate synthase  35.83 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.213774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  31.65 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  34.5 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  31.77 
 
 		 362 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  33.76 
 
 		 350 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  32.62 
 
 		 356 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  34.72 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  31.88 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  33.92 
 
 		 359 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  32.9 
 
 		 353 aa  136  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  35.11 
 
 		 346 aa  136  8e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  31.15 
 
 		 366 aa  136  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  33.81 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 577 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1875  3-dehydroquinate synthase  33.56 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.722069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.26 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  34.33 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 		 350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  33.82 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  33.33 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  33.21 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  33.59 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  33.56 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1920  3-dehydroquinate synthase  34.89 
 
 		 356 aa  133  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>