More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12670 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  100 
 
 		 235 aa  454  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  48.5 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 540 aa  115  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  42.05 
 
 		 179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  44.65 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  45.06 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  43.42 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  45.51 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  47.27 
 
 		 183 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  44.23 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  42.17 
 
 		 180 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  37.87 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  44.17 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  39.52 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  39.52 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.16 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.16 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  43.05 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  42.28 
 
 		 190 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  45.89 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  42.94 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  46.31 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  43.75 
 
 		 519 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  44.03 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  41.42 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  44.37 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  40 
 
 		 174 aa  99.8  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  44.37 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  44.37 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  39.29 
 
 		 179 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  43.4 
 
 		 172 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  42.38 
 
 		 172 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  45.7 
 
 		 208 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1839  shikimate kinase  48.91 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  39.87 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  40.78 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  38.67 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  42.38 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  42.28 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  40.27 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  41.36 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  39.6 
 
 		 180 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  43.33 
 
 		 178 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  39.64 
 
 		 172 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  40.56 
 
 		 161 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  42.76 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  44.94 
 
 		 552 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  41.96 
 
 		 161 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  40.4 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  41.06 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  40.4 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  42.94 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  38.37 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  43.15 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  42.38 
 
 		 172 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  42.67 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  43.36 
 
 		 163 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 		 577 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  44.22 
 
 		 183 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  42.86 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  45.64 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 560 aa  92.8  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  45 
 
 		 185 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  41.55 
 
 		 182 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  41.61 
 
 		 183 aa  91.7  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  43.62 
 
 		 176 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 171 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 594 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1846  shikimate kinase  47.45 
 
 		 167 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  40.12 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  44.22 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  39.61 
 
 		 170 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  41.36 
 
 		 167 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  42.18 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  44.3 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  41.18 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  43.97 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  46 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  43.97 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  37.42 
 
 		 454 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  36.14 
 
 		 171 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  40.74 
 
 		 173 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  45.45 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  41.18 
 
 		 184 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  36.75 
 
 		 171 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  42.18 
 
 		 183 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  42.77 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  37.57 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  38.95 
 
 		 175 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  40.67 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  39.87 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  44.97 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  40.14 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  35.67 
 
 		 163 aa  88.2  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  38.93 
 
 		 172 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  38.93 
 
 		 172 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0938  shikimate kinase  39.76 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.108411  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  37.8 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  40.54 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  40.54 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>