More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1061 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1061  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
439 aa  872    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1222  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.57 
 
 
440 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0503856  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1002  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.71 
 
 
440 aa  619  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0757  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.48 
 
 
439 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0689  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.71 
 
 
439 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.897729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0764  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.71 
 
 
439 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.79 
 
 
439 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1031  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  65.98 
 
 
441 aa  584  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0178353  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1377  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.1 
 
 
442 aa  559  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00581001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1174  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.84 
 
 
487 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0269306  normal  0.392508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  52.5 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.68 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1585  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  52.37 
 
 
448 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.157035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  51.92 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.67 
 
 
448 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.34 
 
 
440 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1612  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.9 
 
 
448 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.23 
 
 
442 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.23 
 
 
442 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.9 
 
 
445 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0931  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
482 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.45 
 
 
441 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4560  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.59 
 
 
441 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0556  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  50.44 
 
 
474 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.23 
 
 
442 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1209  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.86 
 
 
496 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.59 
 
 
441 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.11 
 
 
446 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1545  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.5 
 
 
495 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
442 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
443 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0003  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  52.49 
 
 
444 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.834513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.24 
 
 
447 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
443 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
443 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.55 
 
 
442 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
442 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.55 
 
 
442 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.02 
 
 
443 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
446 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
440 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  50.56 
 
 
445 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
443 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.34 
 
 
445 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.66 
 
 
443 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
443 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
443 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1879  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  49.14 
 
 
467 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.56 
 
 
457 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.55 
 
 
442 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
443 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  50 
 
 
443 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.09 
 
 
441 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.01 
 
 
446 aa  428  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.89 
 
 
443 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
441 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
443 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.68 
 
 
441 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.55 
 
 
443 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.79 
 
 
443 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.98 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0786394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3570  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.98 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000275746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3588  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.98 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000908384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.32 
 
 
444 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.34 
 
 
446 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4809  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.76 
 
 
463 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0783  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.32 
 
 
495 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3967  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.98 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000121311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
441 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1998  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.79 
 
 
465 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.66 
 
 
443 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
485 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1438  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.08 
 
 
490 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1118  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.85 
 
 
490 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  49.1 
 
 
443 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.98 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.13796e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1106  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.19 
 
 
465 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3253  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.24 
 
 
447 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.24 
 
 
447 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2014  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.45 
 
 
449 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.43 
 
 
440 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50 
 
 
443 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2915  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.24 
 
 
447 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3876  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.19 
 
 
463 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1012  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.77 
 
 
437 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  51.24 
 
 
447 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.23 
 
 
443 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  49.55 
 
 
435 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3652  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.22 
 
 
463 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369358  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  50.11 
 
 
465 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>