More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0556 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0556  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  100 
 
 
474 aa  964    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2014  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.06 
 
 
449 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1100  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  69.03 
 
 
446 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.26 
 
 
483 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1612  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.23 
 
 
441 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1012  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 
437 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.42 
 
 
445 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0065  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.48 
 
 
466 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.215309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0212  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63 
 
 
472 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  59.73 
 
 
444 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.38 
 
 
440 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.19 
 
 
441 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.41 
 
 
441 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.52 
 
 
441 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
441 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.85 
 
 
461 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.19 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.75 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.53 
 
 
440 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.31 
 
 
440 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.87 
 
 
443 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
443 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
443 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
443 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
443 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.05 
 
 
443 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
443 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.2 
 
 
443 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.75 
 
 
442 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.75 
 
 
441 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.75 
 
 
442 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07570  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  55.9 
 
 
462 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000774703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.2 
 
 
443 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.65 
 
 
442 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.65 
 
 
442 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.65 
 
 
443 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.09 
 
 
442 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  54.87 
 
 
443 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.87 
 
 
441 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.98 
 
 
446 aa  508  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.87 
 
 
443 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.65 
 
 
442 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.95 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  54.42 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2495  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.36 
 
 
456 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.68 
 
 
442 aa  504  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.95 
 
 
441 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.55 
 
 
485 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.75 
 
 
443 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.76 
 
 
443 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.76 
 
 
443 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.07 
 
 
446 aa  502  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.17 
 
 
448 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.39 
 
 
448 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.07 
 
 
446 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1585  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.39 
 
 
448 aa  503  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.157035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.76 
 
 
443 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1879  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.57 
 
 
467 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.65 
 
 
443 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.41 
 
 
446 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.49 
 
 
435 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2368  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.17 
 
 
440 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.421768  hitchhiker  0.00000674723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.75 
 
 
447 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.08 
 
 
465 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.32 
 
 
441 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.49 
 
 
447 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2748  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.17 
 
 
440 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.33 
 
 
457 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.85 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  54.82 
 
 
445 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.82 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.33 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2341  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.67 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.320663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.67 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2739  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.07 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.75 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.31 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0738  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.92 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.85 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.33 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0069  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.31 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234013  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.85 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.67 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.96 
 
 
434 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.73 
 
 
435 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.98 
 
 
438 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  53.98 
 
 
443 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03516  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.02 
 
 
442 aa  491  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63794  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0827  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
459 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.198289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.85 
 
 
447 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.75 
 
 
440 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.07 
 
 
446 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  53.41 
 
 
437 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>