10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2381 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  100 
 
 
242 aa  495  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4881  hypothetical protein  40.35 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.27 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  23.66 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0587  hypothetical protein  30.13 
 
 
197 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618354  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  25.95 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  25.58 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  23.24 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  22.73 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  25.73 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>