76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0562 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0562  transport-associated  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  34.46 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  34.46 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  33.78 
 
 
191 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  31.45 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  36.17 
 
 
191 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  36.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  34.75 
 
 
191 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.13 
 
 
202 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1133  transport-associated  42.68 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30.13 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  29.48 
 
 
192 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  28.9 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  28.9 
 
 
192 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  28.9 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  34.82 
 
 
192 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  36.13 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.8 
 
 
202 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  31.21 
 
 
192 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  36.61 
 
 
161 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  33.33 
 
 
188 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  35.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30.25 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  28.32 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  35.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  35.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  35.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  35.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  31.08 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  35.9 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  34.48 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.33 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  34.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  28.93 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  34.75 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  29.46 
 
 
192 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  29.46 
 
 
192 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  28.66 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  28.66 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  32.88 
 
 
217 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  28.66 
 
 
204 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  32.88 
 
 
217 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  30.89 
 
 
214 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  26.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  28.95 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  33.62 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  30.77 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  34.43 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  33.93 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  29.37 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.49 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  35.44 
 
 
163 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  31.97 
 
 
223 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  32.23 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  29.27 
 
 
224 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  32.17 
 
 
214 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>