More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3659 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 439 aa  868    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  41.82 
 
 		 537 aa  295  9e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  41.06 
 
 		 572 aa  277  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  38.65 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  29.51 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  33.25 
 
 		 489 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 384 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  38.42 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  32.33 
 
 		 328 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.21 
 
 		 331 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.71 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 272 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 322 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 280 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 297 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 275 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  32.83 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 288 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 300 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 538 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 547 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30.19 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 533 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.47 
 
 		 534 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 360 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 305 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 324 aa  99.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.08 
 
 		 531 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 267 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 267 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  30.96 
 
 		 292 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 550 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 287 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 310 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 549 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 549 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 549 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 296 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 274 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 295 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 551 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 305 aa  96.7  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 551 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 267 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.05 
 
 		 288 aa  96.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  26.34 
 
 		 279 aa  96.7  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 275 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 275 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 272 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  32.11 
 
 		 298 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 270 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 276 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.83 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 275 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 302 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 271 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 279 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 200 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 269 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 271 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 784 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 341 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 268 aa  93.2  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 270 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.65 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>